Inom jordbruksområdet regleras områden som djurhållning, spridning av gödsel och lagring av gödsel av olika författningar. Miljöbalken är den övergripande miljölagstiftningen och till den hör ett flertal förordningar.
Inom växtnäringsområdet är det främst förordningen (1998:915) om miljöhänsyn i jordbruket samt förordningen (1998:899) om miljöfarlig verksamhet och hälsoskydd som reglerar åtgärder för att minska växtnäringsförlusterna.